隨著技術提升，滴灌系統融入人們生活中，滴灌系統施肥可為施肥提供條件，提高施肥、灌溉效率，降低生產成本，提高產量、品質，提高經濟效益。句容噴滴灌灌溉系統可溶肥隨著滴灌水直接施入作物根系密積區，作物棵間空地上無任何肥料浪費。另一方面滴灌是以小流量以滴水形式滲入根區，非常容易控制。水、肥均不會有深層淋洗浪費，滴灌施氮，肥效可達79%，而傳統灌溉不會超過31%。
滴灌系統施肥的缺陷是有可能堵塞滴頭，肥料須是可溶的，不可溶的肥會迅速堵塞滴頭。肥料原料之間化學反應還會產生沉淀，時間一長，沉淀物會堵塞滴灌系統。施肥均勻度取決于灌溉均勻度，如果滴灌系統均勻度高，則施肥均勻度也高，由此滴灌均勻度是一個非常重要的指標，應當提高滴灌均勻度，灌溉系統采用壓力補償滴頭，在管路的適當方位加裝調壓器。

我們為了避免包衣對滴灌系統產生堵塞，選取少量樣品放入溶解罐中攪拌，然后觀察包衣的溶解情況。如果溶解后包衣物質沉淀到罐底，在施用時，讓注肥器吸取上層溶液，不要攪動肥料溶液整體。尿素、硝酸、硝酸鈣、硝酸鉀溶解時要吸收水中的熱量，水的溫度大幅降低。溶解量可能達不到要求量。為了充分溶解，溶液放幾個小時隨著溫度上升，其余未溶解部分會逐漸溶解，然后就可注入系統。
肥料要溶入肥料1～2小時，才能看出是否有沉淀形成，沉淀量多少。如果溶入水中數小時，溶液仍呈渾沌狀，則有可能堵塞滴灌系統。如果幾種肥料同時施，應在注入系統之前去取樣，以實際同時放入觀察罐中觀察混合后的溶解情況，然后決定是否同時注入。氮肥一般水溶性好，非常容易隨著灌溉水滴入土壤而施入到作物根區，如果控制不當，也很容易產生淋洗損失。